數據平臺讓水稻更易“讀懂”
- 發佈時間：2016-04-13 01:30:40 來源：科技日報 責任編輯：羅伯特
科技日報北京4月12日電 （記者馬愛平）水稻生物學數據庫眾多、資訊量大，但大多是生物學原始數據；國內傳統種質資源數據庫鮮有二次開發功能；國內缺少整合多學科數據的整合性數據庫……如何從海量數據中挖掘有用資訊提供給農業科研工作者，一直是個難題。中國水稻研究所鄂志國、王磊、莊傑雲等創建了“國家水稻數據中心”（http://www.ricedata.cn/），讓難題迎刃而解。
經過10多年的建設，該平臺已發展成為一個以水稻為研究對象，融貫多學科的綜合性數據庫。其所載內容已被他人引用超過350次，它以網站形式為用戶提供資訊，日訪問IP數超過500個，在國內外農學類資訊系統中，訪問量名列前茅。
據悉，研究人員開發係譜數，創建中國水稻品種及其係譜數據庫，收錄國內外水稻品種和育種材料等數據近1.5萬份；構建優異稻種資源數據集和大品種指紋數據集，收集優異稻種資源數據共計5379份。
“本數據庫是國內有關水稻品種資料最全，且唯一帶有係譜追溯功能的數據庫。”中國水稻研究所教授鄂志國説，在係譜追溯分析基礎上，研究人員提出“骨幹親本”評價方法，即對同時代育成的種質和同樣的衍生世代進行量化比較，有助於育种家高效選擇親本。
科研人員還創建水稻功能基因數據庫，以文獻析出的方式整合了國內外報道的水稻功能基因2545個；開發出基於瀏覽器的遺傳圖譜生成程式和基因結構圖生成程式，並對水稻産量關鍵性狀相關數量性狀基因座（QTL）進行圖譜整合。
這一平臺收錄水稻相關術語2300多條，開創性地將此系統應用於水稻功能基因數據庫和參考文獻數據庫的管理；將不同學科數據進行有機整合，有助於節省科研人員的跨平臺檢索時間，提高了效率。
截至目前，該數據庫還為國內有需求的科研與教學單位無償提供“目標種質衍生後代批量查詢”等專項科技服務，幫助育种家評判目標種質在育種中的利用價值，高效選擇親本。
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