新技術平臺能發現更多DNA變體
- 發佈時間：2016-03-03 01:30:29 來源：科技日報 責任編輯：羅伯特
科技日報北京3月2日電 （記者常麗君）DNA由A、G、C、T四個核苷構成。科學家在DNA序列中經常發現許多替代這四個正常字母的變體，它們通常能夠幫助細胞控制基因開關，被稱為“表觀遺傳標記”。以往科學家只能在偶然情況下發現這些變體。而據美國麻省理工學院（MIT）近日消息稱，該校和佛羅裏達大學及其他機構研究人員開發出一套先進的技術平臺，能有系統地發現未知的表觀遺傳標記和變體。
DNA變體通常是在細胞分裂過程中合成DNA時由酶插入其中的，一般作為標記“告訴”細胞何時該把哪些基因打開、哪些關閉。此外，變體還能幫細胞保護自身DNA免受外來細菌、病毒DNA的攻擊。這類變體大都能幫助所有的RNA，包括信使RNA和轉運RNA，實現它們的功能。
MIT生物工程學院的皮特·戴頓教授説：“我們開發出一個技術平臺，可用於發現新變體並描述它們的特徵。”這個平臺把單分子實時測序的觀察能力、比較基因組學的預測能力和生物分析學的探測與識別能力結合在一起，讓研究團隊能有系統地尋找新變體，弄清楚變體是什麼，以及它的作用。
比較基因組學通過篩選不同生物的基因組，找出特殊的DNA序列，為潛在的DNA新變體提供了最初的線索。單分子實時測序儀器在檢測基因組時，遇到非傳統的四種核苷會發出信號。戴頓解釋説，檢測過程中會出現短暫停頓，只要恰當調整軟體就獲得信號，知道它在基因組什麼地方。“這讓你能繪製出整個基因組中的DNA變體。”檢測手段不能揭示變體是什麼，但能確定它的位置。
研究團隊已發現了一個叫做dADG的變體，是細菌防禦系統的一部分，能保護其自身基因組不受病毒感染。研究人員認為，在細菌和病毒中可能有許多尚未發現的DNA變體，它們的發現將會為研究人員提供新的抗生素標靶和生物技術工具。
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