本報記者俞慧友

　　“我們的3000份綠色超級稻基因組原始測序數據，覆蓋了全球25萬份種質基因全部遺傳變異的95％。這份核心數據，將正式通過阿裏雲平臺，向全球免費開放。”9月15日，中國農業科學院、阿裏雲計算有限公司、華智水稻生物技術有限公司、北京聚道科技有限公司在長沙共同啟動“雲之稻項目”，中國農科院農作物基因資源與基因改良國家重大科學工程首席科學家黎志康如是告訴科技日報記者。

　　3000份水稻核心種質基因組測序數據，是科技部和比爾·梅琳達蓋茨基金會“為非洲和亞洲資源貧瘠地區培育綠色超級稻”重大科技專項的重要課題成果，這也是迄今為止全世界最大的植物基因組測序項目。項目旨在培育能夠廣泛適用於灌溉和雨養地區生態環境，並具氮磷高效利用、抗病、抗蟲、高産、優質、抗逆（乾旱、鹽鹼）等特性的水稻新品種，在目標國示範推廣，推動雜交稻種子生産能力，併為撒哈拉以南非洲國家、亞洲和中國的西南地區水稻分子育種建立一個高效水稻基因型分析技術平臺。

　　3000份水稻核心種質基因組測序數據能做什麼？

　　為水稻核心種質做基因組測序，是一項龐大工程。黎志康領銜的團隊，耗費了兩年半的時間，才獲得這3000份水稻核心種質基因組測序數據。一位超級稻科研工作者接受科技日報記者採訪時表示，該基因數據庫資源，至少有兩方面用途，一是從基因庫調取數據，研究目標基因的分佈、進化和功能。二是可分析基因組之間的多態性位點，並以之開發分子標記，甚至是基因晶片，用於分子育種。

　　黎志康認為，通過對3000份水稻核心種質基因組測序分析，能夠回答水稻有多少遺傳多樣性可以應用，從哪獲取生物育種所需遺傳資源的問題，分析得到的數據將為水稻基礎認識和生物育種提供基礎資訊資源。這項研究可揭示全球栽培稻資源的基因組多樣性，和每個水稻資源的遺傳特點及應用價值。此外，將3000份水稻種質資源帶入水稻育種應用中，將為水稻育種創新提供材料和新思路，對數據的分析結果還將填補人們對水稻甚至各個物種在基因組學方面的知識空缺。

　　“基因組大數據是水稻分子育種的基礎。我們正承擔有建設國家水稻分子育種大平臺的任務，也希望通過對3000份水稻基因組序列進行深度分析，重點挖掘出水稻種質資源的重要遺傳區段，為種業公司提供優質的分子標記開發，全基因組關聯分析和優良農藝性狀定位等種業高科技服務。”華智水稻生物技術有限公司總經理張健説。

　　四方聯袂擬打造最全“水稻功能基因組和育種資訊數據庫”

　　3000份水稻基因組測序項目分析得到的數據量將達到幾百TB，處理如此大規模的基因組數據，科研機構要具備相應存儲和計算能力既不現實，也會造成重復配置資源。為此，四方機構共同啟動“雲之稻項目”，協議將3000份水稻種質資源基因組測序數據通過阿裏雲平臺，無償向全球共用數據，項目組還擬建立最全“水稻功能基因組和育種資訊數據庫”，為基礎研究和育種應用提供可供參考的重要資訊。這不僅有利於加快規模化發掘水稻優良基因，突破水稻複雜性狀分子改良的技術瓶頸，還能加快高産、優質、廣適性新品種培育的進程，全面提升我國及全球水稻基因組研究和分子育種水準。

　　水稻基因數據公益雲平臺構建於阿裏雲的對象存儲服務和批量計算服務之上。阿裏雲對象存儲服務（OSS），是阿裏雲自主研發的分佈式存儲系統，具海量存儲空間和幾乎無限的擴容能力，能通過多重數據冗余備份和自動故障恢復機制保證數據安全。通過OSS提供的免費存儲和下載服務，雲之稻項目的水稻基因組數據可以隨時為全球科學家所用。同時，阿裏雲批量計算服務是專門針對基因數據分析等計算密集型應用設計的分佈式雲服務，其自動的資源管理、靈活的任務調度和工作流支援，可大大簡化在雲上搭建水稻基因分析平臺的過程。

　　基因大數據的分析處理必須面對很多難題，比如海量數據傳輸，數據安全和許可權隔離，數據調度和處理如何簡潔高效，以及如何尋找穩定可靠且低成本的存儲資源等。聚道科技開發了GeneDock基因數據雲服務平臺，針對基因數據格式使用獨特壓縮演算法，大大降低數據存儲和傳輸成本，研發了行業一流的分佈式調度和執行引擎，大大提高任務運作速度，降低運作成本。用戶在雲之稻（http://www.RiceCloud.org）下載數據，可直接在雲端對3000份水稻核心種質基因組數據進行分析挖掘。

　　項目目前已經對用戶免費開放，後期還將陸續推出新的分析工具，方便科研工作者深入分析水稻基因組數據。“後基因組時代，這個項目還將結合功能基因組學新的方法和策略進行生物育種，貢獻于糧食安全和食品健康的發展。我希望全球水稻研究同行，能充分利用這一平臺，也希望國家有關部門能給予關注和扶持，促進生物大數據行業的快速發展。”黎志康説。（科技日報長沙9月16日電）