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民豬全基因序列圖譜完成

  • 發佈時間:2015-11-08 01:29:59  來源:科技日報  作者:佚名  責任編輯:羅伯特

  科技日報哈爾濱11月7日電 (記者李麗雲 實習生康曉嘯)7日,黑龍江省農科院對外發佈,由國家生豬産業技術體系崗位科學家、黑龍江省農科院劉娣教授帶領的研究團隊,與中國農業大學胡曉湘教授團隊共同合作,利用高通量測序技術,完成民豬的全基因組從頭測序工作,成功繪製全基因組序列圖譜。經查新確認,該圖譜為我國首部民豬全基因序列圖譜。

  隨著引入豬品種的衝擊,很多珍貴的國內地方豬資源瀕臨滅亡。作為黑龍江省唯一的地方豬品種,民豬被列入國家品種資源保護名錄。民豬具有繁殖力高、肉質優良、抗病、耐粗飼、能在冬季寒冷條件下生存的特點,在世界豬品種改良、性能提升中貢獻巨大,對其進行綜合性系統研究與保護利用,能更好地保證我國豬品種的多樣性。2014年6月至2015年10月間,兩團隊共同合作,完成了民豬基因組測序與圖譜繪製工作。

  據劉娣介紹,該課題研究人員使用近300G的雙端測序數據,構建出民豬全基因組序列圖譜,得到的基因組大小約為2.64Gb;通過與人、鼠和杜洛克基因組的同源基因資訊相比對,研究人員成功預測出20853個蛋白編碼基因,檢測出1200萬個單核苷酸突變位點和180萬個插入/缺失突變。此外,研究人員通過對民豬編碼的正選擇分析,共得到22個受到正選擇的基因。與肌肉澱粉合成酶、肌糖磷酸酶及緩激肽受體等能量代謝相關的基因受到了顯著的正選擇。

  中國工程院院士馬建章認為,民豬全基因序列圖譜的完成不僅能夠促進養豬産業、綠色食品産業的發展,而且為日後對民豬的全面研究奠定了基礎,有利於該品種資源的保護、開發和利用。

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