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中國院企聯合啟動“雲之稻”項目平臺 加速“水稻設計育種”

  • 發佈時間:2015-09-15 20:00:00  來源:中國新聞網  作者:佚名  責任編輯:羅伯特

  中新社長沙9月15日電 (記者 劉柱)中國農業科學院、阿裏雲計算有限公司、華智水稻生物技術有限公司、北京聚道科技有限公司15日在長沙共同宣佈啟動“雲之稻”項目平臺——3000份綠色超級稻基因組原始測序數據(下稱“3000份水稻基因組”)。

  上述合作者稱,根據協議,“雲之稻”項目平臺將無償向全球共用數據,並將逐步建立最全面的“水稻功能基因組和育種資訊數據庫”,其研究將加快規模化發掘水稻優良基因,突破水稻複雜性狀分子改良的技術瓶頸,加快高産、優質、廣適性新品種培育進程,全面提升中國及全球水稻基因組研究和分子育種水準。

  “3000份水稻基因組”是源於國家科技部和比爾·梅琳達蓋茨基金會資助的“為非洲和亞洲資源貧瘠地區培育綠色超級稻”重大科技專項(簡稱“綠色超級稻”)重要課題成果,是迄今為止全世界最大的植物基因組測序項目。

  “3000份水稻基因組”代表了25萬種子中95%的多樣性,其重要性在於分析得到的數據將為水稻的基礎認識和育種提供基礎資訊資源。

  華智水稻生物技術有限公司資訊總監王冰冰透露,目前,“3000份水稻基因組”分析得到的數據量達到幾百TB(萬億字節),如按常規方式處理如此大規模的數據,單個研究團隊、科研機構均會遇到下載難、存儲難、分析難、運算難等問題,費時費力且成本高。

  阿裏雲高級專家林河山介紹,“雲之稻”項目平臺是構建在阿裏雲的對象存儲服務和批量計算服務之上,在解決上述難題的同時,“‘雲之稻’項目平臺上的雲端基因組數據還可以隨時為全球科學家所用”。

  “‘雲之稻’項目平臺是公益性的,不僅讓研究者免費下載訪問水稻基因組數據,還提供常用分析工具和數據。”王冰冰説,通過使用這些工具可以免費調用阿裏雲的計算資源,從而方便快捷地對基因大數據進行分析。

  綠色超級稻項目首席科學家、中國農業科學院作物科學研究所黎志康博士表示,“3000份水稻基因組”的測序需要全世界所有科學家和有興趣的人士通過“雲之稻”項目平臺參與數據分析和共用,為加速未來的“水稻設計育種”提供基礎資訊資源,“‘雲之稻’項目還將結合功能基因組學新的方法和策略進行生物育種,將貢獻于糧食安全、食品健康的發展”。(完)

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