智庫建設，並不意味著所有研究機構和研究人員都要一窩蜂地轉向應用研究。基礎理論研究絕不能因為智庫的發展而荒廢，致力於基礎理論研究的學者也不應被強迫轉向應用研究。現在有不少研究人員對智庫建設表現出抵觸情緒，這與不合理的一窩蜂的智庫建設以及研究機構負責人的“野蠻”政令是有關係的。對此，一方面，科研管理機構要做好統籌，使科研機構明確自己在新形勢下的分工；另一方面，科研機構自身也要認清自己的特色和專長，在保持自己研究優勢的基礎上有的放矢地進行智庫建設。
