對不同地區而言，厄爾尼諾的影響可謂“冰火兩重天”。一般而言，厄爾尼諾會導致太平洋西北地區及俄勒河流域冬季氣溫反常偏高，天氣乾燥，同時又會致使南部地區出現反常暴雨。在厄爾尼諾年，印度尼西亞、澳大利亞、南亞次大陸和巴西東北部可能出現乾旱，而從赤道中太平洋到南美西岸則多雨，在北美地區則是有利於大平原的降水。對於大宗商品而言，厄爾尼諾可謂是一隻“黑天鵝”。

　　從歷史經驗看，厄爾尼諾發生時，農産品首當其衝，特別是咖啡、可可受影響明顯，其次是白糖、橡膠和小麥、玉米等。

　　咖啡、可可：在厄爾尼諾之年，受影響最大的是咖啡、可可豆等品種的全球價格。咖啡的全球産量集中在巴西，約佔全世界40%左右。作為全球波動率最高的品種，如果熱帶地區氣候異常，咖啡價格便會急速上漲。

　　瑞銀證券指出，1997年至1998年，全球遭遇強厄爾尼諾，這段時期咖啡價格上漲逾200%；即便2009年全球遭遇一次較小的厄爾尼諾時，咖啡價格也從2009年下半年開始上漲近100%。

　　同屬熱帶作物的可可豆，其産量也基本集中在非洲（迦納、尼日利亞、喀麥隆等）和南美地區（巴西、墨西哥）。據國際可可組織預計，厄爾尼諾將使全球可可平均減産2.4%。2014年上半年可可豆價格已上漲了30%，達到兩年來的高點。根據歷史經驗來推測，如果天氣繼續惡化，可可豆價格將被進一步推高20%-50%。

　　白糖：除了兩個高波動率的品種，厄爾尼諾對糖價的影響也不容小覷。甘蔗適宜種植在熱帶和亞熱帶，主要生産國為巴西、印度和中國。甘蔗生長髮育過程需要較高的溫度和充沛的雨量，一般要求全年大於10℃的活動積溫為5500℃-6500℃，年日照時數1400小時以上，年降雨量1200毫米以上，然而過量的降水對甘蔗的成長則會起到適得其反的作用。

　　歷史上，厄爾尼諾現象給巴西地區帶來大量的降雨，給甘蔗收穫造成嚴重風險。據統計，2009年7月-2010年4月發生了一次中等強度的厄爾尼諾，造成巴西中南部降水偏多。過量的降水使得甘蔗糖含量下降，最終導致巴西2011/2012年度甘蔗總産量下降6%。受此影響，國際糖價連續9個月上漲，一度飆升至32.64美分/磅，創下歷史最高值，累計漲幅達119.71%。此外，2009年的厄爾尼諾還曾引發了印度40年來最嚴重的旱災，導致全球蔗糖價格大幅上漲。

　　銀河證券的研究報告曾指出，若2014年發生厄爾尼諾現象，巴西、印度等主産國的甘蔗生産將會受到影響，2014/2015年度的全球白糖供求將會趨於緊張，這將有助於全球糖價的回升。

　　大豆：相比于厄爾尼諾可能給咖啡、可可和白糖等作物帶來的減産，大豆則是受益於厄爾尼諾的品種。如果不出現極端洪澇災害，厄爾尼諾給太平洋東部帶來的充沛降雨，有利於改善南美及美國南部地區的深層土壤墑情。歷史數據顯示，在發生厄爾尼諾的年份，美國、巴西和阿根廷等主産國的大豆産量增長的概率更大。從CBOT大豆的歷史價格走勢看，在1997-1998年那次較嚴重的厄爾尼諾期間，大豆價格反而下跌了4%。

　　分析人士認為，目前全球大豆庫存相對較高，庫存消費比也創新高，如果後續厄爾尼諾現象適宜大豆豐産，則大豆價格有進一步下行的空間。

　　油脂：油脂方面，在預期的厄爾尼諾威脅下，分析師普遍看好棕櫚油價格。“部分農産品有望走出牛市行情，比如油脂類品種。”南華期貨分析師傅小燕接受中國證券報記者採訪時曾指出，如果厄爾尼諾發生在7、8月份，並且持續時間較長，對棕櫚油至少會産生2%以上的減産幅度。

　　國投中谷期貨農産品研究員董甜甜也表示，市場重現厄爾尼諾炒作，油脂或能獲得短期支撐，在此過程中或將伴隨菜棕縮小等機會，油脂整體仍舊會在大豆供給壓力下維持底部築底過程。”

　　橡膠：除了農産品，橡膠也難以獨善其身。目前，全球橡膠的産地分佈主要是在南北緯15度以內，主要集中在東南亞地區，種植面積佔到了全球的90%以上，另外中國的雲南、海南等地也有種植。橡膠樹對氣象條件的要求主要是光、溫、水和風。橡膠生産的適宜溫度是在18℃-40℃之間，高産還需要充足的光照，同時橡膠耗水比較多，年降水量2000 毫米以上適合生長，但是降水量過多時也會引髮膠原病，影響産膠量。除此之外，強風也可能對樹木造成不可逆轉的傷害，所以採割期的災害型天氣會對橡膠産量産生較大影響。

　　資料顯示，厄爾尼諾發生會對全球橡膠産量産生較大影響。例如，2009年7月至2010年4月發生的厄爾尼諾，令東南亞很多地方遭受乾旱，印尼2009年橡膠産量同比下降11.3%，橡膠價格持續上漲至2011年。2009年7月至2011年1月期間，天膠期貨價格累計漲幅達118.7%，其間更是創出歷史最高價。據印尼農業機構預測，若發生厄爾尼諾，2014/2015年度印尼橡膠産量將同比下降3%。