首個“現代蛙類”基因組破譯
- 發佈時間：2015-03-18 01:29:59 來源：科技日報 責任編輯：羅伯特
科技日報訊 （記者馬波）中科院昆明動物研究所張亞平院士以及車靜研究員課題組與華大基因國家基因庫及德克薩斯大學奧斯汀分校等單位合作，成功破譯了首個“現代蛙類”——高山倭蛙的基因組。
研究人員估算高山倭蛙和熱帶爪蟾的分歧時間大概在266百萬年前。儘管兩者分歧時間很久，但是兩物種染色體間的重排特別少，説明蛙類基因組可能具有相對較慢的進化速率。這一猜想在染色體內部重排速率、基因區及全基因組的替換速率等多個層面都得到證實，即兩棲動物，甚至整個冷血動物，具有比恒溫動物更低的進化速率。
高山倭蛙基因組的破譯，使我們進一步確認了更多的人類、鳥類、蛙類基因組中的染色體斷裂和融合區域，同時也鑒定了兩棲動物中高度保守的區域，為後續的兩棲動物比較基因組學提供了良好的研究基礎。儘管四足動物有3.6億年的進化史，在人的染色體中仍可以看到較長的祖先序列被完整保留下來。通過分析染色體斷裂，融合事件，發現人的染色體間重排最劇烈，雞和兩棲動物染色體間重排相對較少。最後，該研究還發現了高山倭蛙特有的三類抗菌肽（AP01357，AP00097，和AP01583），其中AP01583已被證實在氧化應激和應對病原微生物方面具有重要作用，這些特有抗菌肽的存在可能在高山倭蛙適應高海拔環境中起一定保護作用。
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