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中國科學家完成世界首個鯉魚基因組圖譜

  • 發佈時間:2014-10-08 15:08:00  來源:中國經濟網  作者:佚名  責任編輯:馬巾坷

  中國水産科學研究院黑龍江水産研究所8日對外發佈,由該院孫效文研究員領銜的國際合作研究團隊,完成了鯉魚全基因組序列圖譜繪製,並揭示其獨特的全基因組複製事件,這是國際上首個完成全面解析的異源四倍體硬骨魚類基因組圖譜。該研究成果近日發表于《自然-遺傳》(NatureGenetics)雜誌。

  鯉魚是全球分佈和養殖範圍最廣泛的經濟魚類之一,是中國具有代表性的淡水養殖魚類,是最有條件利用基因組資源進行品種改良的水産養殖物種。鯉魚基因組由100條染色體組成,是迄今完成全基因組測序的脊椎動物中染色體數目最多的物種。

  該研究團隊完成了雌核發育鯉魚的基因組深度測序、精細圖譜繪製和基因組註釋,其基因組由16.9億鹼基組成,含有52610個功能基因,約為多數硬骨魚類基因數目的兩倍。研究團隊從基因組尺度證實了鯉魚基因組的異源四倍體特徵及其獨特的全基因組複製事件,分子鐘證據表明鯉魚基因組四倍化大約發生在820萬年前,是迄今在脊椎動物中發現的最近的全基因組倍增事件。研究團隊還開展了全球10個代表性品係(種群)33尾鯉魚的基因組重測序研究,首次繪製了全球鯉魚的單鹼基解析度基因組遺傳變異圖譜。此外,通過全基因組多態性掃描和比較轉錄組分析等手段,識別和定位了鯉魚鱗被缺失、體色決定等性狀相關的遺傳位點、功能基因和調控通路。

  鯉魚全基因組序列圖譜的完成,標誌著鯉科魚類重要經濟性狀的遺傳解析和遺傳選育研究全面進入基因組時代。對於解析鯉科魚類生長、品質、抗病、抗逆等重要經濟性狀的分子機制具有重要意義,同時也為研究脊椎動物基因組進化和基因衍化機制提供了寶貴的數據和模型,為開展全基因組選擇育種,培育品質優良的鯉魚新品種奠定了堅實基礎,具有重要的理論意義和應用價值。

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