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世界首個棗全基因組測序完成

  • 發佈時間:2014-10-31 01:30:48  來源:科技日報  作者:佚名  責任編輯:羅伯特

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  科技日報訊 (記者劉廉君)10月29日,國際權威科學雜誌《自然通訊》線上發表了以河北農業大學劉孟軍教授為第一和通訊作者的棗基因組測序重大研究成果《棗複雜基因組測序及其果樹生物學性狀解析》。他們在世界上率先完成了棗樹的全基因組測序,並使棗樹成為世界鼠李科植物和我國乾果中第一個完成基因組測序的物種,標誌著我國在棗組學研究方面達到國際領先水準。

  棗樹原産我國,已有7000多年栽培歷史,年産量600萬噸,佔世界99%。2010年,劉孟軍帶領其棗研究團隊,通過與華大基因公司等合作,成功完成了對我國著名棗品種“冬棗”的全基因組從頭測序。

  該項目組裝出總長4.38億個鹼基的高品質基因組序列,達到棗估測基因組大小的98.6%,並且將其中80%的鹼基錨定到棗的12條假染色體上;預測出32808個蛋白質編碼基因,從中發現了大量的棗特色基因,特別是在第一號染色體上,發現了一段與棗樹獨特生物學性狀密切相關的高度保守區域。

  在完成基因組測序組裝基礎上,對棗樹多個優異性狀的形成機制進行了深度研究。棗果是世界上已知維生素C(Vc)含量最為豐富的果品之一,高出蘋果數十倍,甚至超過有“Vc王”之稱的獼猴桃,但棗果為何能夠大量積累Vc,一直是個謎。本項目通過比較基因組研究,結合轉錄組測序和Vc代謝分析,首次發現棗果同時具有柑橘和獼猴桃兩種高效積累Vc的分子機制。

  該研究對揭開棗樹進化和生長髮育之謎、加速棗樹分子育種必將産生重大而深遠的影響,對鼠李科乃至其他果樹的分子遺傳改良也具有十分重要的理論借鑒和潛在應用價值。

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