大黃魚全基因組精細圖譜繪製完成
- 發佈時間：2015-05-04 03:35:50 來源：科技日報 責任編輯：羅伯特
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科技日報訊 （李來）4月2日，國家海洋局第三海洋研究所、浙江大學、深圳華大基因研究院、青島海洋大學和深圳大學聯合完成了大黃魚全基因組測序，並繪製出大黃魚基因組精細圖譜。研究揭示了大黃魚對環境脅迫應答的分子機制，為抗逆性的遺傳改良提供了重要資源。該成果線上發表于國際著名學術期刊《美國公共科學圖書館——遺傳學》。
大黃魚是中國和東亞國家最具經濟價值的海洋魚類之一。其具有特殊的行為和生理特性，對於低氧和空氣暴露等環境脅迫極為敏感。這些特性使大黃魚成為研究環境脅迫應答機制的良好模型。為了探索大黃魚對環境脅迫應答的分子和遺傳機制，研究人員採用BAC組裝策略與全基因組鳥槍法相結合的方法，克服了大黃魚基因組的高雜合特性，對大黃魚全基因組進行了測序，並獲得了大黃魚基因組精細圖譜。組裝的大黃魚基因組大小為679 Mb，包含25401個蛋白編碼基因。
此外，研究人員還對大黃魚進行了腦部低氧轉錄組和皮膚粘液蛋白質組的研究。研究揭示了神經—內分泌—免疫/代謝新的調控網路在大黃魚腦應答低氧脅迫中起到了關鍵的作用。他們還發現暴露在空氣中的皮膚黏液含有3209種基因編碼的蛋白，這是目前在魚類黏液研究中發現最多的，這些蛋白的主要功能抗氧化、氧氣運輸等，揭示了皮膚黏液蛋白在大黃魚應對空氣暴露脅迫中的多重保護功能。
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