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深圳基因測序貢獻超全球五成

  • 發佈時間:2014-12-18 05:31:36  來源:南方日報  作者:佚名  責任編輯:羅伯特

  僅僅用了15年的時間,深圳企業華大基因就從支援1%人類基因組計劃到成長為為世界基因測序貢獻超過50%的企業。

  2009年以來,深圳陸續將生物産業、生命健康産業分別作為戰略性新興産業和未來産業重點培育和支援,而到2013年深圳的生物産業規模就突破了1000億元,其基因測序的産出能力佔了全球50%以上,並擁有全國唯一的國家基因庫,集聚了華大基因、袁隆平院士團隊、邁瑞、海普瑞等一批高層次的團隊和知名企業。

  華大基因研究院院長兼CEO王俊日前接受南方日報採訪時稱,作為全球規模最大、技術領先的基因組學研究機構,華大基因的研究和臨床應用將使得普通人也能負擔起基因檢測的費用,未來有望借助這個方法增進健康、延長壽命。據其介紹,目前個人全基因組測序價格接近上萬元,而明年將降低至幾千元,華大基因正在計劃推出相關新産品。

  ●南方日報記者 馬芳

  構建“數據王國”,打造“生物版谷歌”

  1999年,華大基因支援了人類基因組計劃的1%,而近年來,華大基因的基因測序能力則讓其在世界基因測序上的貢獻超出了50%。當1999年成立的華大基因2007年遷至深圳時,它被形容為“裸奔”而來。如今,華大基因5000余名員工分佈在世界各地,平均年齡僅27歲。位於深圳鹽田區北山工業區的華大基因總部,前身是一個舊鞋廠,而2017年將啟用的、位於深圳大梅沙的華大基因中心,將更能體現其在國際生物領域的領先地位。

  2010年,華大基因購入了128台世界上最先進的DNA測序儀器,當時每台市場報價約70萬美元。2013年底,華大坐擁178台不同品牌的測序儀,每年可實現5萬人的基因組測序,數據生産規模達到近5PB,輸出的數據量約佔全球基因組數據總量的50%。

  在外界看來,早期的華大基因似乎像是一個巨型數據生産機,甚至被不少人誤認為是“生物領域的富士康”,但華大基因對海量生物資訊數據的處理、分析和解讀能力,是其躋身國際基因組領域一流研究機構的關鍵要素,這種優勢使其越來越難以複製和替代。自1999年成立以來就一直很重視大數據的華大基因,正在構建一個“數據王國”,提出打造“生物版谷歌”的未來暢想,對於生物技術與大數據碰撞的前景表示樂觀。

  生物技術是全球繼資訊技術之後發展速度最快、發展潛力和空間最大的産業,也是將會在未來幾十年對全球經濟影響最深刻的産業,以基因組學為代表的前沿的生物技術推動著人類對生命世界的認識水準發生質的飛躍。全球頂尖科研機構和企業都通過與華大基因的合作來強化自身在組學領域的能力,加速自身的研發進度,以便將相關科學發現、新技術更快地推向産業化。

  2014年12月12日,華大基因、深圳國家基因庫、《科學》雜誌等聯合發佈了中外200余位科學家共同完成的鳥類基因組系統演化史項目重大成果,當天,在《科學》和其他雜誌上以專刊形式集中公佈了28篇首期研究成果,這些成果中有8篇刊登在《科學》鳥類專刊上,其餘20篇將陸續刊登在Genome Biology等雜誌上。這也是國內機構首次以專刊的形式在《科學》雜誌上發表如此多的研究成果。

  深圳市市長許勤在12日的發佈會上評價,華大基因的成就影響著全球的生物技術和生物産業的發展。他表示:“以基因組學為代表的前沿的生物技術推動著人類對生命世界的認識水準發生質的飛躍,我們認識客觀世界最後來認識自身,是一個國家和地區生物技術發展水準的集中體現”。

  華大基因創始人之一、董事長汪建稱,科學界特別是民間科學界、民營的科學家也能在深圳創造出影響世界發展的奇跡,做出引領型的創新,相信我國未來的創新也能夠從“追趕型”更多地向“引領型”轉變。

  華大基因的重點研究方向包括人類健康、動植物基因組、微生物基因組等。從創立初期的人類基因組測序計劃,到2003年破譯SARS病毒基因組序列,到研製出埃博拉病毒核酸檢測試劑,華大基因顛覆了主流科研單位的實驗室模式,用工業化的組織方法來實現大數據採集,將BT與IT高度結合。截至今年12月初,華大基因已經在《自然》、《科學》等頂級學術雜誌上發表了160多篇高水準論文。

  明年華大測序成本將大幅降低

  在研究成果層出不窮的同時,華大基因在産業化方面也取得了很多進展,旗下的華大科技、華大醫學、華大農業、華大製造等機構在各個領域不斷開拓。

  2013年3月,華大基因通過旗下子公司並購了美國納斯達克上市公司Complete Genomics(簡稱“CG”),CG讓華大基因有了自己的“軍工廠”,不再依賴進口測序儀器。面對即將“爆發”的基因測序市場,華大基因可以大規模生産各種測序儀器。

  王俊近日告訴記者,華大基因收購CG後,已經完全把測序的平臺自主化、國産化,在此基礎之上使得測序成本超摩爾定律的發展應用在基因組學領域,15年前做一個人類基因組需要花費30億美金,現在已經接近上萬,明年又可以再降低,幾千元就可以做一個人的全部基因組。

  “我們不是以盈利為目的的機構,也不是以發表文章為目的的機構,我們就是想用基因組的平臺和技術,最終做點老百姓能受用的事。”王俊曾告訴記者,華大所有的研究都是從民生應用開始思考,研究沿著産業鏈逆流而上,每一項研究領域如農業、生育健康、腫瘤、慢性病等都有從科研到産業化的完整鏈條。

  在醫學方面,以基因測序領域最廣為人知的、針對唐氏綜合徵篩查的無創産前基因檢測為例,截至12月初,華大基因已在全球範圍內做了40萬例無創産前基因檢測。隨著多種基因檢測項目的增加,華大醫學的業務預計會有很大的發展空間和上升潛力。

  在農業育種方面,華大基因計劃建立世界領先的基因分型平臺、基因挖掘平臺和全基因組分子育種技術平臺,其中開放的育種平臺將向大中小企業開放,基於該平臺,中小型公司投入一兩百萬元甚至幾十萬元,就可以在兩三年內確保實現一個動物或植物品種的改良,有利於保障農業生態的安全。

  作為華大基因旗下最年輕的機構,華大製造過去近一年時間裏建立了深圳、武漢兩地的儀器和試劑生産車間、品質管理體系。2014年7月,華大製造的第一個系列産品——兩款測序儀及配套的胎兒染色體非整倍體檢測試劑盒,獲得了CFDA醫療器械註冊證,這是全球首個獲批的真正意義上的高通量測序臨床應用産品。

  ■數字

  96個疾病位點

  華大基因旗下的華大科技今年11月起啟動了寵物基因檢測項目,主要針對寵物狗單基因遺傳病進行檢測,範圍涉及到視力、腎臟、骨骼、神經、皮膚等方面的。隨著技術的成熟,華大科技後續將推出寵物狗品種鑒定、育種指導等服務,同時也會開發其他寵物(貓,鳥)的基因檢測項目。

  100萬英鎊

  華大基因今年7月與英國愛丁堡大學簽署合作協議,雙方將攜手推動人工合成酵母基因組研究的突破,開展高達100萬英鎊的人工合成生物學項目,在Edinburgh Genome Foundry進行酵母七號染色體合成。酵母七號染色體基因組合成的成果將廣泛應用於化工生産、能源和糧食領域,以維持和改善人類健康和環境。

  1267個人體

  腸道微生物樣本

  華大基因研究院等多家單位的科研人員今年7月聯合發表了迄今為止最具代表性、最高品質、近乎完整的人類腸道微生物參考基因集數據庫,研究成果在國際期刊《自然生物技術》線上發表。

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