虛擬篩選加快藥物研發速度
- 發佈時間：2014-10-14 01:30:42 來源：科技日報 責任編輯：羅伯特
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科技日報訊 （記者劉園園）由北京市計算中心開發的“電腦輔助藥物篩選平臺”，近日正式開放。該平臺運用虛擬藥物篩選技術，提供蛋白質靶向小分子化合物的篩選和優化服務，有望使該類藥物的早期研發時間縮短一半。
“這是我國第一家商業化的虛擬藥物篩選平臺，可以通過網際網路向國內外藥物研發科研院所和企業提供遠端服務。”主持平臺研發的北京市“海聚工程”人才趙勇博士告訴科技日報記者。
趙勇介紹，小分子化合物類藥物是現代藥物大家庭中佔比最大的一類。通過和人體內導致疾病的蛋白質發生作用來發揮療效。“蛋白質的三維結構就像一套房子一樣有不同的‘房間’，如果導致疾病的‘房間’被小分子化合物堵住，它的功能就停止，疾病就得到治療”。
“利用這一特性，我們可以在電腦中建立小分子化合物和蛋白質的三維模型，並利用相關軟體進行二者的模擬對接，最終篩選出可能調節蛋白質功能的小分子化合物。”趙勇説，這樣就可以把藥物篩選工作交給電腦來做。
趙勇告訴記者，“電腦輔助藥物篩選平臺”依託運算能力達每秒200萬億次的超算集群，10萬個小分子化合物和一種蛋白質上某個“房間”的對接工作最快1個小時便可完成，費用也只有5000元左右。“傳統實驗篩選的命中率只有十萬分之一到萬分之一，虛擬藥物篩選的命中率在2%在40%之間，是實驗篩選命中率200倍以上”。
趙勇説，早期藥物研發一般需要三到五年時間，借助虛擬篩選平臺有望縮短到兩年以內。
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