青花菜病害以病毒病、黑腐病、霜霉病較為常見，蟲以菜青蟲小菜蛾、甘藍夜蛾、蚜蟲較多，要及時防治，對症下藥，減少損失。
病毒病可用病毒A、植病靈防治；黑腐病可用農用鏈黴素、可殺得等防治；霜霉病可用甲霜靈錳鋅、殺毒礬、克露等防治。主要蟲害有菜青蟲、小菜蛾、甘藍夜蛾、蚜蟲等，可用阿維菌素、功夫、吡蟲啉、除盡等防治，此外，使用頻振燈誘殺成蟲效果較好，可以大大減少農藥的使用，減少蔬菜産品中農藥的殘留，還可降低成本。田錦芬
