2013年12月—2014年12月，農業部部署完成了階段性打擊侵權品種和制售假劣種子行為專項行動。以雜交玉米、雜交稻為重點作物，以制種基地和案件高發地為重點地區，以清理整頓違法生産經營主體為主線，查辦並曝光一批大案要案，堅決退出一批問題品種，吊銷一批違法企業種子生産經營許可證，搗毀一批黑窩點，嚴懲一批不法分子，致使2014年種子市場秩序有根本性好轉。

　　2013年12月~2014年4月開展企業整治

　　●檢查企業生産經營資質、生産經營檔案、品種授權合同、種子去向等。

　　●抽取企業生産經營的所有品種樣品，進行相關指標檢測。

　　2014年2月下旬開展春季市場檢查。7月~8月開展秋季小麥、油菜種子品質檢查。

　　●檢查經營門店，包括種子標簽、經營檔案、臺賬、相關合同或委託書等，對於所經營的品種查清來源，抽取種子樣品檢測相關指標。

　　●檢查集中交易大市場，除檢查上述內容外，還聯合工商查清各攤位的註冊所在地。

　　●檢查中抽取70%以上的品種（其中本省企業生産經營品種佔60%以上）。

　　●對於直銷入戶比例較大的地區，入戶倒查。切實查清種子來源和品種真實性。縣級種子管理機構深入本轄區50%以上鄉鎮開展入戶倒查，每個鄉鎮抽查不少於5個行政村，每村抽查不少於5個農戶。

　　2014

　　年1月~5月開展品種清查。

　　●退出沒有生産面積、存在重大缺陷、未上交標準樣品的品種。逐一核查近兩年新審定的品種，對未及時上交標準樣品的，一併退出。

　　●在網路或新聞媒體上向社會通報退出品種清單。

　　●在進行品種清查的同時，做好市場檢查，對經營退出品種者和經營未審定品種者依法嚴肅處理。

　　2014年5月~11月開展早稻、雜交玉米、中晚稻制種基地整治。

　　●播種前及時核對種子生産許可證、制種品種、生産地塊資訊，建立相關資訊數據庫，檢查是否具有品種權許可或制種委託手續，是否與制種戶簽訂生産合同等。

　　●在種子收穫前組織拉網式檢查，抽取生産品種的種子樣品，進行真實性檢測。

　　●在種子初加工環節，抽樣進行品種真實性檢測。

　　●在種子調運季節，檢查調運種子的生産許可、去向和數量，同時抽樣檢測真實性。

　　2014年全年開展大案要案查處。

　　●案件資訊實現農業、公安、工商三部門、案發地與種子調入調出地共用。

　　●行政執法與刑事司法銜接，堅決杜絕“有案不移、以罰代刑”等行為。

　　●對於公安部門查處的案件，需要技術鑒定的，農業部門及時組織檢測或田間鑒定。

　　●上級農業主管部門對重大案件掛牌督辦。

　　●及時向社會通報大案要案查處結果。