我國率先構建野生大豆泛基因組
- 發佈時間：2014-09-16 07:51:49 來源：科技日報 責任編輯：羅伯特
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科技日報訊 （記者瞿劍）中國農業科學院作物科學研究所與諾禾致源等合作，在國際上率先構建和分析了一年生野生大豆的泛基因組，為作物種質資源研究和利用提供了新的方法和啟示。該研究成果9月14日線上發表于國際著名學術期刊《自然—生物技術》。
項目牽頭人、中國農科院作科所研究員邱麗娟介紹，大豆是重要的油料和高蛋白糧飼兼用作物。栽培大豆由其祖先種一年生野生大豆經過人工選擇進化而來，其中所蘊藏的優異基因的開發和利用對拓寬現代大豆品種的遺傳基礎，改良品質，提高對病蟲害的抗性及對不良環境與氣候變化的適應性具有重要意義。我國大豆資源總數居世界首位，其中一年生野生大豆佔全世界野生大豆的90%。她表示，近年來，我國乃至世界大豆育種難以取得突破性進展、單産停滯不前，主要原因是目前大豆品種的遺傳基礎狹窄，匱乏的基因源成為制約栽培大豆育種研究的關鍵。
項目組通過十餘年大豆核心種質構建及遺傳多樣性研究發現，大豆是高度自交作物，一個基因組無法準確代表其物種基因的整體情況。為此，在系統研究基礎上，選擇7份有代表性的野生大豆進行從頭測序和獨立組裝，構建了野生大豆泛基因組。利用一套基於全基因組序列比對的結構變異鑒定方法，項目組率先在全基因組水準上全面解析了野生和栽培大豆種間遺傳變異，特別是在闡明大豆種內／種間結構變異方面取得了突破，發現野生大豆特有、栽培大豆特有及馴化性狀建成相關的基因／遺傳變異千余個，其中野生大豆特有基因為首次報道。此外，發現野生大豆中與生物逆境抗性相關的R（抗病）基因類型，可能是其抵禦惡劣生存環境的內在原因之一。
