桃全基因組重測序揭秘桃進化歷史
- 發佈時間：2014-08-18 02:31:22 來源：農民日報 責任編輯：羅伯特
日前，中國農業科學院鄭州果樹研究所王力榮研究團隊與深圳華大基因聯合開展的桃全基因組重測序工作取得階段性進展。該研究對84份桃種質進行重測序，在全基因組水準上繪製了從光核桃到普通桃的進化路線，並鑒定了與人工選擇相關的候選基因。相關研究結果線上發表于《基因組生物學》。
據項目主持人王力榮研究員介紹，普通桃起源於我國西藏的光核桃，然而在這兩個種之間的其他近緣種的進化關係一直以來存在爭議。通過此次重測序，可以確定普通桃的進化始於光核桃，之後為山桃，再次為甘肅桃，最終形成普通桃，而新疆桃只能認為是普通桃的一個地理類群。
另外，與其他果樹相比，桃有個有趣的現象，即桃由於自交親和，一直被認為是遺傳多樣性較低，然而桃上可以看到多種類型，如有毛的毛桃、無毛的油桃、扁平的蟠桃和油蟠桃，重瓣的花型、不同的花藥顏色等，這些性狀的多樣性在其他果樹如李、杏、櫻桃、蘋果和葡萄上是看不到的。研究發現，與野生的近緣種相比，雖然普通桃單核苷酸多態性（SNPs）只有野生桃的62%，然後在這些SNPs中，普通桃特有SNPs佔到其總SNP的47.3%，該結果很好地解釋了桃多樣性的矛盾現象。
桃重測序也發現，由於桃自交親和及長期採用嫁接繁殖，在馴化過程中桃的雜合率急速衰減，普通桃高的純合率不僅為解析其表型性狀的分子機制提供便利，也為桃作為薔薇科果樹分子生物學研究的模式樹種提供了有力的證據。
本報記者吳佩通訊員吳斯洋
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