我國率先完成寨卡病毒全基因組序列測定
- 發佈時間:2016-02-26 08:58:31 來源:人民日報海外版 責任編輯:吳起龍
春節期間,我國廣東省出現寨卡病毒輸入性感染病例後,軍事醫學科學院微生物流行病研究所迅即啟動應急工作機制,與廣州市第八人民醫院、出入境檢驗檢疫系統相關單位密切合作,在獲得從委內瑞拉歸國患者臨床標本後,採用高通量測序技術,于2月21日直接從尿液中獲得病毒全基因組序列。
據專家介紹,這是我國首次獲得寨卡病毒全基因組序列,也是全球首次直接從患者尿液中獲得病毒全基因組。該病毒基因組全長10.8kb,系統進化分析表明,屬於亞洲世系,與巴西、蘇利南、波多黎各等美洲國家流行毒株同源性為99.7%;核苷酸序列比對發現20個突變位點,其中5個突變位點導致氨基酸改變。
專家指出,寨卡病毒全基因組序列的獲得,為病毒的溯源和進化提供了重要證據,可用於指導診斷試劑、疫苗和藥物的研發,使我國在全球寨卡疫情防控中佔得先機。同時,直接從患者尿液獲取病毒全基因組序列,解決了複雜臨床樣品中病原體高通量測序的技術難題,為臨床診療方案和出院標準的優化提供了科學依據。
寨卡病毒屬於黃病毒屬黃病毒科,是一種主要由伊蚊傳播的蟲媒病毒。1947年首次在烏干達寨卡叢林中的恒河猴體內分離出該病毒,全長基因組序列在2007年被測出。雖然目前還沒有輸血傳播病例發生,但已經在個別供血者血樣中檢測到寨卡病毒,他們是無症狀的寨卡病毒感染者。感染寨卡病毒的人群中通常僅有20%的人發病,潛伏期為3至12天。寨卡病毒流行的地理分佈、臨床表現與登革熱、基孔肯雅熱十分相近,且均為蚊蟲叮咬傳播,因此很容易造成誤診。