合浦營盤港-英羅港儒艮保護區

　　儒艮

該保護區主要保護對像是儒艮（gn）、中華白海豚等珍稀水生動物、海草床。

漓江光倒刺鲃金線鲃國家級水産種質資源保護區

　　大鯢（娃娃魚）

該保護區主要保護對象為光倒刺鲃（〔bā〕）、金線鲃、漓江鱖（gu）、黃喉擬水龜、花鰻鱺、多瘤麗蚌、大鯢、長麥穗魚等魚類，以及冠岩潭、浪洲潭2個魚類越冬場，黃牛甲、社公灘、鬥米灘、鴛鴦灘4個魚類産卵場。

恭城古木源娃娃魚區級水産種質資源保護區

該保護區位於恭城縣三江鄉三聯村古木源區域，主要保護對像是國家二級重點保護水生野生動物大鯢及其棲息地。

資源縣牛欄江大鯢區級水産種質資源保護區

該保護區主要保護對像是國家二級重點保護水生野生動物大鯢及其棲息地。

西江梧州段國家級水産種質資源保護區

　　廣東魴

該保護區主要保護對像是鯪（lng）、鳡（gǎn）、廣東魴（fáng），其他保護對象包括日本鰻鱺、赤眼鱒（zūn）、斑鱧（lǐ）、月鱧、花鱸等。該江段還是國家一級保護水生野生動物中華鱘的洄遊通道。