冠軍揭曉！2024『猛犸杯』國際生命科學數據創新大賽-歐洲·演算法賽圓滿落幕

2024年6月19日,由深圳國家基因庫、華大生命科學研究院、國際數據委員會共同發起,華大基因和華大智造主辦的2024『猛犸杯』國際生命科學數據創新大賽-歐洲·演算法賽(2024  MICOS-EU)決賽在塞爾維亞貝爾格萊德順利舉辦。

經過初賽、復賽的嚴格評審篩選,6支隊伍從100多個參賽團隊中脫穎而出進入最後決戰。經過激烈角逐決出最終結果:來自蘇黎世聯邦理工學院的“Curious”團隊榮獲一等獎,另外5支來自University of Belgrade、IDATA、University of Kragujevac、SynBio AI  Lab和重慶科技大學等機構的團隊分別榮獲二、三等獎和優秀獎。

上圖:冠軍頒獎

2024  MICOS-EU聚焦科研熱點時空組,旨在有效解決空間轉錄組數據聚類演算法的準確性和效率問題。自今年4月正式啟動以來,共吸引來自中國、瑞士、塞爾維亞、新加坡、丹麥、西班牙等國家和地區的100余支團隊參與。

6月19日,2024  MICOS-EU決賽與貝爾格萊德生物資訊學會議(BelBi2024)在塞爾維亞貝爾格萊德同期舉行。貝爾格萊德大學、塞爾維亞分子遺傳學與基因工程研究所、Ana  and Vlade Divac Foundation和華大教育中心等機構的專家作為嘉賓/評委蒞臨現場參與本次決賽。

晉級團隊 終極PK

2024  MICOS-EU決賽于6月19日順利舉行,華大生命科學研究院院長徐訊以線上視頻的形式為本次決賽致辭。徐訊院長表示:“我們很高興將MICOS帶到歐洲,這是MICOS大賽的一個重要里程碑。  期待決賽中創新演算法的涌現,為空間轉錄組學數據處理提供突破性解決方案,進一步推動多組學數據研究的進步!”

在答辯環節,進入決賽的6支團隊分別對各自的演算法/模型展開精彩介紹。每支參賽團隊陳述結束後,評委專家進行提問,隨後從演算法/模型創新性、架構設計、複雜度以及答辯過程的PPT陳述、邏輯性等方面進行評分。

本次大賽的最終評分由線上得分和答辯得分兩部分組成,按二者加權後的最終得分進行排名。經過激烈的角逐,本次大賽的結果正式揭曉:

冠軍團隊開發的AESTETIK演算法為空間轉錄組學研究産生的海量多模態數據中的聚類問題提供了卓越的解決方案,尤其是在解決異質細胞群癌症組織研究等精準醫療挑戰中表現出色。

AESTETIK是一種卷積深度學習模型演算法,整合了空間轉錄組學研究涉及的多種數據類型:轉錄組數據、空間位置、組織形態等,並基於10x  Genomics、NanoString、Stereo-seq等多個技術平臺産生的數據集進行性能優化和提升,在下游分析任務中取得了優異的成績,性能和效果遠超其他已知演算法。

上圖:決賽現場

至此2024 MICOS-EU圓滿收官。作為MICOS大賽的首個海外賽道,2024  MICOS-EU獲獎的6支優秀參賽團隊根據時空轉錄組數據集分析任務目標,提出了6種不同的聚類演算法思路並進行了改進,為時空組多模態數據分析提供突破性解決方案。

2024 MICOS-EU賽事組織機構

發起單位:深圳國家基因庫、華大生命科學研究院、國際數據委員會

主辦單位:華大基因、華大智造

協辦單位:貝爾格萊德大學電氣工程學院、塞爾維亞分子遺傳學與基因工程研究所

贊助單位:華訊網路、深圳市藍色億點科技有限公司

*大賽組委會保留對本次大賽的最終解釋權。