加強工業污染防治，嚴格環境準入。各市從嚴審批高耗水、高污染物排放等建設項目，對造紙、焦化、氮肥、有色金屬、印染、農副食品加工、原料藥製造、製革、農藥、電鍍等十大重點行業，實行新(改、擴)建項目主要污染物排放等量或減量置換。2017年年底前，各類工業集聚區要全面實現污水集中處理並安裝自動線上監控裝置，對逾期未完成的，實施涉水新建項目“限批”，並依照有關規定撤銷其園區資格。
對於排污企業，山東將實施“紅黃牌”管理，逐一排查工業企業排污情況；對超標和超總量的企業予以“黃牌”警示，一律限制生産或停産整治；對整治仍不能達到要求且情節嚴重的企業予以“紅牌”處罰，一律停業、關閉。自2016年起，定期公佈環保“黃牌”“紅牌”企業名單。按照國家進度安排，2017年年底前完成各類污染源排污許可證的核發工作，禁止無證排污或不按許可證規定排污。
同時，《方案》稱，各市要依法淘汰落後産能，分年度制定方案。對未完成淘汰任務的地區，實施相關行業新建項目“限批”。山東將全面排查裝備水準低、環保設施差的小型工業企業，2016年年底前全部取締不符合産業政策的小型造紙、製革、印染、染料、煉焦、煉硫、煉砷、煉油、電鍍、農藥、澱粉、魚粉、石材加工等嚴重污染水環境的生産項目。
山東推進居民階梯水價制度
非居民用水2020年底前將全面實行新制
在城鎮生活污染防治方面，今後山東將整治城市黑臭水體。各設市城市限期完成建成區黑臭水體排查，公佈黑臭水體名稱、責任人及達標期限。以解決城市建成區污水直排環境和垃圾沿河堆放問題為重點，濟南、青島城市建成區2017年年底前基本完成黑臭水體治理任務，其他市城市建成區2020年年底前黑臭水體控制在10%以內。
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