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走進科技抗“疫”一線:3個“疾控人”的40天

來源:中國網    時間:2020-02-28 12:58:20    編輯:陳姝悅


  為抗擊新冠肺炎,成都啟動首批8個應急科技攻關項目,成都市疾控中心承擔的“成都地區新型冠狀病毒疫情應急響應模式的構建及應用”即是其中之一。構建成都市新型冠狀病毒肺炎病例及密切接觸者實時採集分析系統、掌握成都市新冠疫情的流行特徵、探索成都市新冠病毒肺炎的時空分佈規律……這些,都是這個應急科技攻關項目中的重要組成部分。
 
  如今,作為抗擊新冠肺炎的“排頭兵”的疾控人,正在和時間賽跑,在一線戰“疫”的同時,群策群力推動應急科技攻關。他們“連軸轉”了1個多月,每天工作超過16個小時,熬過數不清的夜……而他們的目標只有一個,希望用科技賦能戰“疫”。
 
 
  72小時採集分析系統


  在成都市疾病預防控制中心新冠肺炎疫情應急指揮中心,新冠肺炎密切接觸者採集分析系統發出新的提示。這套密切接觸者數據採集分析系統是成都市疾控中心應急與業務管理辦公室主任庹曉莉和團隊緊急科研攻關的成果,從研發到上線,僅僅用了72小時。
 

 
  正在運作的這套“成都市新型冠狀病毒肺炎病例及密切接觸者實時採集分析系統”也是成都市疾控中心承擔的科技攻關項目中的重要一部分,得到了成都市科技局的大力支援,在當下的疫情防控中發揮了重要作用。
 
  庹曉莉駐守的成都市疾控中心新型冠狀肺炎疫情應急指揮中心,每天要處理大量資訊和指令,串聯起疫情防控公共衛生響應全鏈條,是疾控指揮調度及資訊匯總分析的樞紐,成都市每日新冠肺炎疫情最新情況的數據即來源於此。每天工作超過13個小時,有時候甚至通宵加班,電話24小時線上,這早已成為庹曉莉工作的常態。
 
  對密切接觸者追蹤管理,是疫情防控中的重要環節。如何精準的做到資訊共用和統計分析,更是成為了疫情決策的關鍵。
 
  在成都市科技局應急攻關項目的支援下,庹曉莉和團隊當機立斷,決定在已有的疾病監測系統上,新建一個針對新冠密切接觸者的實時採集分析系統。“時間就是生命,我們必須分秒必爭。”庹曉莉説,我和我的團隊每天都見縫插針與研發團隊商量、討論,修改……目的就是讓這個系統能夠儘快上線。
 
 
  僅僅用了3天時間,成都市新型冠狀病毒肺炎病例及密切接觸者實時採集分析系統1.0版上線,它將所有確診病例、疑似病例以及密切接觸者納入一個完整的數據庫,分級分類管理,快速追蹤。
 
  獲取密接者資訊的速度大大加快了;密切接觸者追蹤管理效率大大提高;資訊組數據採集匯總分析效能大大增強;……科技化手段對疫情防控工作帶來的效率提升立竿見影。
 
  庹曉莉説:“目前我們管理的密接者累計已達到6000多人,在管的還有數百餘人。可以想像,這麼大工作量,如果沒有這個資訊系統,要完成實時資訊共用和精準分析,靠再多的人都實現不了。”
 
  當然,努力並沒有止步於此,庹曉莉和其團隊還在計劃不斷完善系統功能。“一方面,系統採集資訊的功能息需要完善。比如,現在關注‘返港復工’人員的情況,我們的系統也會增加相關數據的採集。另一方面,系統的統計分析的功能也需要不斷完善,為我們深入分析新冠肺炎疫情特徵提供支撐。”庹曉莉説,下一步,我們還計劃聚焦數據的可視化呈現,把“枯燥”的數字代表的意義表達出來。而在未來,其他的傳染病防控,這套系統也將繼續發揮重要作用。
 
  5小時一張“人物關係圖”

  自新冠肺炎疫情爆發以來,成都市疾控中心流行病學調查組副組長、傳防科副科長岳勇所帶領的成都市疾控中心流行病學調查組,就早已奔波各處醫院、隔離點。而這樣的現場調查,每一例短則2-3小時,多則甚至要3-5小時。隔著密不透風的防護服,艱難的記錄著每一次問答,他們只為找到“蛛絲馬跡”,迅速確定所有密切接觸者。
 
  岳勇,先後經歷了2009年甲型H1N1流感疫情、2014年西非埃博拉暴發、中東呼吸綜合徵、2017年人感染H7N9禽流感等重大的新發傳染病疫情處置的他,對一線傳染病防控有著豐富的經驗。而這次他和他的團隊,也成為了這樣一群在疫情“一線”與時間、與疾病“賽跑”的疾控人。
 
 
  岳勇和他的團隊,從疫情暴發以來就一直衝鋒在第一線,白天黑夜連軸轉,很多時候都把辦公室當家,住在這裡。
 
  在本次疾控中心承擔的成都市應急科技攻關項目中,即提出要“掌握成都市新冠疫情的流行特徵”、“通過典型的聚集性疫情案例,探索分析新型冠狀病毒的傳播模式”……而要弄清這些問題,岳勇和他的團隊正在進行的流行病學調查就至關重要。
 
  “流調”即流行病學調查。學術上解釋為,用流行病學方法進行的調查研究。主要用於研究疾病、健康和衛生事件的分佈及其決定因素。通過這些研究提出合理的預防保健對策和健康服務措施,並評價這些對策和措施的效果。
 
  “目前我們對新冠病毒的了解有限,還需要不斷的加深認識。這需要我們在開展流調中,對每一個疑似或者確診病例展開調查,以盡可能細緻地摸清他們的行動軌跡,找到其他密切接觸者,並從流行病學上分析病毒特徵,最終形成資料報告。”在岳勇看來,“只有這些工作做的越深入,資訊越細緻,儘快掌握一手資料,才能為疫情防控提供支撐,並形成有效的防控經驗。”
 
  來自岳勇和他團隊提供的“流調”數據,是每一天清晨,我們最關注的資訊。“流調”是一項瑣碎、細緻的工作,但是至關重要,岳勇和他的團隊,如今依然“戰鬥”在疫情一線, 而他們形成的一個個“流調”報告,也正在為科研攻關提供著有力的數據支撐。
 
  用GIS系統探索病毒時空分佈規律
 
  在疾控中心微檢科收樣室,成都市疾控中心科研教育資訊管理科副主任杜長慧在緊張有序審讀區縣隨同標本一起上交的流調報告的間隙,還在抓緊時間構思測試GIS技術和時空分析方法在疫情防控中如何發揮作用。
 
  在他的電腦螢幕上,顯示的是一張成都市地圖,而他所做的,正是希望把新冠病毒的時空分佈規律在地圖上展示出來,為我們更好了解新冠病毒的地域傳播,提供一個新的破題思路。
 
 
  為了進一步提高流調報告的品質,杜長慧在收樣室審讀上送標本的流調報告,溝通區縣流調人員補充報告中需要完善的地方。從大量的流調報告中,杜長慧發現被調查對象的個體傳播軌跡迫切需要一種展示技術,他邊審讀報告,邊整理個體傳播軌跡的表現形式,一遍又一遍用各種GIS方法和技術進行研究和測試,以期儘早給出一套成熟的展示技術用於現在的疫情防控。
 
  作為牽頭人之一,杜長慧和團隊成員已完成了大量的方法和技術測試和準備,數據整理和分析也在有序開展。據杜長慧介紹,此前團隊也計劃在成都地區諾如病毒的分子流行病學研究引入GIS系統,以研究病毒進化時空分佈規律,已積累了一定的研究基礎,此次也希望通過這項技術為新冠疫情防控提供幫助和支援。
 
  與此同時,經過前期收集病例和密接的流行病學資訊、採集病例的標本,微生物檢驗科將建立基因測序方法,挑選合格標本進行測序與進化分析,整理並數字化流調資訊。最終,在GIS系統和分子溯源技術的助推下,將有望展示新冠病毒的傳播模式及病毒進化的時空分佈規律。
 
  一環扣一環的科技攻關,將不僅為我們探索新型冠狀病毒的傳播機制提供研究基礎,也將為未來疫情防控與政府決策提供科學依據。(溫彩苓)
 
 
 

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