作為備用核反擊指揮部,E-4B搭載有13套專用通信設備及46組天線,其中包括位於機背整流罩內的超高頻衛星通信天線(可與部署在全球各地的美軍指揮部進行通信)以及佈置在機尾的可用絞盤收放的全長達8千米的超低頻拖曳天線(用於同水下的戰略核潛艇進行通信)。E-4B最多可搭載114名乘員。圖為作戰參謀室資料圖,可見其搭載的電子設備均經過抗EMP攻擊設計。