為了更好地體現今年“名城會”的主題定位及主要內容，組委會組織徵集設計了新會標。新會標以梅紅色為主色調，以國畫為主要表現形式，以梅花和2006年“名城會”的中英文名稱為元素而構成。採用遒勁的國畫筆觸將“世界歷史文化名城博覽會”的英文縮寫“WHCCE”勾勒出南京市市花——梅花的造型。
　　
    梅花具有傲立風雪的頑強品質，是南京這座歷經滄桑的歷史文化名城的象徵。會標中的梅花極具動感的造型，寓意著南京是一個充滿生機與活力的城市。會標既具有濃郁的南京地域特色，同時也體現了“名城會”的國際化色彩。中、英兩種文字點明的“名城會”名稱象徵著“名城會”是中外文化交流的平臺。“名城會”名稱上方的一抹紅色國畫筆觸既象徵著南京文脈源遠流長，也象徵著東西方文化融會貫通。會標採用紅色，寓意熱情、希望和生機，代表熱情的南京人民與海內外朋友們“相聚在文化名城，狂歡在博愛之都”的期盼與喜悅之情，也象徵著南京文化事業和文化産業的蓬勃發展。