遵義會議後中央成立了由毛澤東、周恩來和王稼祥組成的三人軍事領導機構，即“新三人團”。這一軍事領導機構在指揮作戰中發揮了重大作用。目前許多著述中把毛澤東作為“新三人團”的首要領導人，這種説法是值得商榷的。雖然毛澤東在指揮作戰中作出了許多關鍵性的決策，而且遵義會議的召開逐步確立了毛澤東在黨內的領導地位，但這並不能説明“新三人團”是以毛澤東為首的。事實上，“新三人團”從它一開始成立之日起，就不是以毛澤東為首的，而是以周恩來為首的，毛澤東在其中起著決定性的作用。這是因為：
第一，遵義政治局擴大會議上決定取消博古、李德和周恩來組成的三人團，“仍由最高軍事首長朱德、周恩來為軍事指揮者，而周恩來同志是黨委託的對於指揮軍事下最後決心的負責者”。按常委的分工，毛澤東只是作為周恩來軍事指揮上的幫助者。
第二，從當時中共中央對軍事領導成員的分工來看，周恩來當時任紅軍總政治委員，是代表中共中央管紅軍的，毛澤東在職務上是低於周恩來的。1935年毛澤東被任命為前敵政治委員也是由周恩來和朱德聯署的。
第三，從實際部署作戰的軍事決策過程看，周恩來具有最後決定權。這與毛澤東和周恩來在以後對此事的回顧相吻合。毛澤東回憶當年的情形時説，這個三人團，團長是周恩來，我和王稼祥是團員，三人團是以周恩來為首的。周恩來也在後來的回憶中説，“從遵義一齣發，就遇到敵人一個師守在打鼓場那個地方，大家開會都説要打，只有毛主席一個人説不能打。但別人一致通過要打，毛主席也只好服從。但毛主席回去一想，還是不放心，覺得這樣做不妥，半夜裏提馬燈又到我這裡來，叫我把命令晚一點發，還是想一想。我接受了毛主席的意見，一早再開會議，把大家説服了。”從這段話中可以看出，主持軍事會議，作出軍事決策，發佈作戰命令的，就是周恩來。
第四，從現有的有關新三人團的任何原始資料來看，都沒有提及新三人團是以毛澤東為首的。同樣在與之相關的當事者的回憶錄中，我們也沒有發現這樣的提法。比如説周恩來同志，在“文化大革命”期間，一向維護毛澤東個人威信，在一次談到三人團的講話中，也只是説三人小組由毛主席、稼祥和我組成，三人小組指揮軍事作戰，而並沒有説三人小組是以毛澤東為首的。
當然，“新三人團”名義上的為首者與實際上操權決策者並不一定統一。從當時的情況看，遵義會議後，中共中央指揮軍事的實際權力在周恩來與毛澤東之間微妙地轉移著，毛澤東顯然在新三人團中實際上起著非常關鍵的作用。但我們不宜簡單地説“新三人團”以毛澤東為首，如果要説以周恩來為首，同時則需要説明毛澤東在其中起著決定性作用。