京港地鐵16號線西苑站主體為地下三層結構，2642平方米的站廳位於地下一層，是寬敞開闊的通廳；站臺層位於地下三層，是常見的站臺在中間、軌行區在兩邊的島式站臺。車站共設2個出入口，分別為A口（西北口）、B2口（東北口），其中，A口通道內有連通地面與站廳的無障礙直梯，方便乘客進出站。中國網記者 鄭亮攝影