2006年，自治區黨委、政府為加快廣西北部灣經濟區全面開放開發步伐，進一步加強泛北部灣區域經濟合作，決定在南寧市規劃建設區域性國際物流基地，通過廣西北海、欽州、防城港沿海港口功能的延伸與在南寧市“無水港”口岸港區和大型保稅加工區有機結合，優勢互補，共同發展，進一步增強南寧市的綜合競爭力，充分發揮南寧市在多區域合作中的核心帶動作用，著力構建北部灣（廣西）經濟區大通道、大流通、大工業、大市場的發展新格局。

經過反覆論證研究，南寧區域性國際物流基地初步選址于：北至湘桂鐵路復線，西到銀海大道，東至平樂大道附近的三角狀區域，規劃用地面積18.6平方公里，距市中心22公里，距南寧國際機場30公里，南邊距離廣西三大優良港口欽州港90公里、防城港120公里、北海港180公里。該物流基地設置南寧保稅物流中心、出口加工區、商貿物流區、普通物流區、商務園（辦公園區）、展覽區、配套生活區及公園等八大功能區，擬建設成為設施一流、環境一流、管理一流的國際現代綜合物流區和城市綜合功能區，為中國—東盟自由貿易區的貿易往來、大西南出海通道的貿易往來以及泛珠三角經濟區的貿易往來服務。

南寧區域性國際物流基地建設的重點是海關特殊監管區，即加快建設南寧玉洞保稅物流中心，著力推進南寧、北海、欽州和防城港四城市“區港聯動”的形成。自治區政府在今年2月27日向國家海關總署報送了《關於在北部灣（廣西）經濟區建設海關特殊監管區的專題報告》，提出要在南寧規劃建設保稅物流中心。為配合自治區的申報工作，我市隨即制定了《南寧保稅物流中心（B型）建設工作方案》，提出力爭用2年時間，建成一個規劃科學、功能完善、技術先進、運轉高效、管理規範的服務於中國—東盟經濟圈、西南經濟圈和華南經濟圈一流的現代化保稅物流中心。

南寧保稅物流中心規劃面積為1平方公里，依託南寧高新技術開發區、南寧經濟技術開發區、中國—東盟經濟園區等我市及區內外大型的産業基地保稅物流服務的需求，延伸港口的保稅功能區，擴大綜合服務功能，實現南寧、北海、欽州和防城港四城市的“區港聯動”，形成具有一流軟硬體設施和一定規模的國際物流節點，統一構建現代化的物流裝卸堆場和電子口岸平臺，提供完善的進出口貨物訂艙、報關、倉儲、轉机、配送等功能，實施“口岸分撥、多點申報、一次放行”的新型物流大通關模式，“十一五”期間，南寧玉洞保稅物流中心將以保稅倉庫建設為主要內容，開辦進出口貨物保稅倉儲、國際物流分撥配送、簡單加工和增值服務、進出口貿易、轉口貿易、物流資訊處理及其他經海關批准的國際業務，滿足各方企業對採購、製造、運輸、銷售等物流一體化的要求，把物流基地發展成為採購中心、加工中心、配送中心、運輸中心和資訊交流中心，實現物流一體化服務。