6月16日0—24時，31個省(自治區、直轄市)和新疆生産建設兵團報告新增確診病例44例，其中境外輸入病例11例(甘肅10例，四川1例)，本土病例33例(北京31例，河北1例，浙江1例);無新增死亡病例;新增疑似病例3例，均為本土病例(均在北京)。
當日新增治愈出院病例2例，解除醫學觀察的密切接觸者116人，重症病例增加2例。
境外輸入現有確診病例102例(無重症病例)，現有疑似病例2例。累計確診病例1856例，累計治愈出院病例1754例，無死亡病例。
截至6月16日24時，據31個省(自治區、直轄市)和新疆生産建設兵團報告，現有確診病例252例(其中重症病例7例)，累計治愈出院病例78379例，累計死亡病例4634例，累計報告確診病例83265例，現有疑似病例7例。累計追蹤到密切接觸者754269人，尚在醫學觀察的密切接觸者4683人。
31個省(自治區、直轄市)和新疆生産建設兵團報告新增無症狀感染者11例(境外輸入4例);當日轉為確診病例6例(境外輸入1例);當日解除醫學觀察9例(境外輸入4例);尚在醫學觀察無症狀感染者106例(境外輸入62例)。
累計收入境澳臺地區通報確診病例1602例。其中，香港特別行政區1112例(出院1069例，死亡4例)，澳門特別行政區45例(出院45例)，台灣地區445例(出院433例，死亡7例)。
