雅魯藏布江源頭是中國西藏喜馬拉雅山脈北麓的傑馬央宗冰川(rje ma g.yang vdzoms),上游稱馬泉河(rta mchog kha vbab),自西向東橫貫西藏南部;流經米林後,于墨脫以北切穿喜馬拉雅山,繞過喜馬拉雅山脈最東端的南迦巴瓦峰轉向南流,形成世界第一大峽谷——雅魯藏布大峽谷;之後在巴昔卡出境,經過中國和印度有爭議的藏南地區之後進入印度阿薩姆邦,改稱布拉馬普特拉河;進入孟加拉國以後稱為賈木納河,在孟加拉國境內與恒河相匯,最後注入孟加拉灣,形成世界上最大的三角洲。
雅魯藏布江的源流有三支:北支發源於岡底斯山脈,叫馬容藏布;中支叫切馬容冬,因常年水量較大,被認為是雅魯藏布江的主要河源;南一支發源於喜馬拉雅山脈,叫庫比藏布,該支流每年夏季水量較大。三條支流匯合後至裏孜一段統稱馬泉河,但在扎東地區也有稱該江為達布拉藏布,藏語馬河之意;或叫馬藏藏布,藏語為母河之意。拉孜地區叫羊確藏布。拉孜以西,雅魯藏布江統稱達卓喀布,藏語意為從好馬的嘴裏流出來的水。