通過對水稻基因組序列框架圖的詳盡分析，中國科學院基因組資訊學中心暨華大基因研究中心的專家估計，水稻基因組中基因總數在４６０２２至５５６１５個之間，並基本確定了其中一萬多個基因的功能。水稻基因總數幾乎是人類基因組基因總數的兩倍。

    美國華盛頓大學王剛博士説：“我們津津樂道於人類自己基因組的優越時，可至少在基因數目上已輸給了養活人類的水稻。”

    科學家同時發現水稻基因“頭尾”差別大，大部分水稻基因的頭部與尾部組成不一樣，這種差異增加了基因發現的難度。水稻基因組中的小基因難以發現，而人類基因組中的大基因則難以發現。

    科學家還發現，水稻基因組的“垃圾”多在基因外。水稻、擬南芥與人類基因組都有很多不編碼蛋白質的“垃圾”序列。水稻的這些“垃圾”序列多位於基因之外，而人類卻在基因之內。正因為如此，水稻基因的平均長度只有４５００個鹼基，而人類基因的平均長度為７２０００個鹼基。科學家據此估計這些“垃圾”裏面肯定有“寶貝”，超級雜交稻“雜種優勢”的奧秘很可能與這些“垃圾”中的“寶貝”有關。

    水稻是禾本植物的代表。科學家在對比後發現，禾本植物的基因差別也比較大。都屬於禾本科的水稻、小麥、高粱、玉米等是單子葉植物，擬南芥、大豆等是雙子葉植物。擬南芥已發現有２５０００個基因，８０％左右的基因在水稻的基因組中都可找到；而水稻基因組中只有一半不到的基因在擬南芥基因組中找到，找不到的基因中有相當一部分是新的基因。根據擬南芥已分類的基因，對大約一萬個水稻基因進行了功能分類，在數量上，水稻和擬南芥之間有關信號傳導的基因差別最大。（李斌）

    新華社 2002-4-5