根據“建國黨”的黨章,“建國黨”中央組織以合議制為主,設有決策委員會、紀律委員會、提名委員會與諮詢委員會等。在中央黨部內的行政部門則包括文宣部、政策部、組織訓練部、社運部、財務部及出版部。決策委員會由15~21人組成,黨主席與兩名副主席為當然成員,黨務部門的各部主任也在其中,整個決策委員會類似一“內閣”。諮詢委員會類似黨的顧問團。“建國黨”將以承算制度來控制黨的財務狀況,計劃除出版書刊報紙來籌募黨的資産外,絕大多數的經費來源將以政治獻金及募捐為主。
“建國黨”確定“以建立獨立的台灣國為永不改變之最高宗旨”。其黨綱主要內容有:“堅持台灣絕不是中國的一部分”、“以台灣全體國民為主體,以台灣本島及其附屬島嶼為領土範圍,形成‘命運共同體’”、“建立三權獨立的國家”、“促使台灣進入國際社會,與世界各國包括中國在內,建立平等、互惠及和平的正常外交關係”、“堅持以台灣為主體的教育與文化”、“透過各種運動深入台灣社會,聯合社會各階層共同致力完成 ‘獨立建國’ 的最終目標”等。此外 ,“建國黨”主張“單一制國會”,取消省、市級建制,因而聲稱將參加“總統”、“立委”和縣市級公職選舉,不參加“國代”及省市公職選舉。
“建國黨”主張, 透過各種運動深入台灣社會, 發起“教育本土化運動”、培養“台獨意識”與“台獨人才”。這些 “台獨” 分子主張重組 “中、 小學課程標修訂委員會”,大學應從速成立“台灣文學系、所”;中小學語文課程應秉持“台灣、現代、實用”原則進行教學,學校史地、美術、音樂等課程應以台灣為中心;當局應籌設“台灣文化資産研究所”,“行政院文化建設委員會”,其活動方向是促進文教本土化;“國史館”應廣搜台灣文獻進行台灣歷史的系統化研究, 保存與維護台灣古跡、文物等。 為了宣傳“台獨”理念, 培養台灣民眾的“台獨意識”, 籌辦黨報《創國傳真報》,並計劃在全台灣設置10~18座電視臺與廣播電臺。