宜賓學院教師首次獲得油樟基因組資訊

發佈時間:2024-07-17 16:10:08 | 來源:中國網 | 作者: | 責任編輯:趙茜

近日,宜賓學院農林與食品工程學部嚴寬,四川省油樟工程技術研究中心主任魏琴等教師的學術論文《Chromosome genome assembly of the Camphora longepaniculata (Gamble) with PacBio and Hi-C sequencing data》(《油樟染色體基因組組裝與註釋》)在《Frontiers in Plant Science》(《植物科學前沿》)上線上發表。

該研究對油樟基因組進行測序、組裝和註釋。結果表明,油樟基因組大小為702.29 Mb,重復序列佔比約為60.39%;經初步組裝和品質評估,三代測序片段回比到基因組的比對率為99.62%;BUSCO基因集中能完整比對到單個基因的佔比為94.49%。在油樟基因組中預測到的基因數量為39,173個,其中有36,632個基因被註釋到功能,佔基因集總數的93.51%。這説明本研究獲取了高品質的油樟基因組,這是油樟基因組資訊首次被獲得。該研究為中國特有香料植物資源油樟進一步的分子育種等研究提供了關鍵性基礎數據。

嚴寬副教授為成果的第一作者,魏琴教授、外籍教師Ahmed H.El-Sappah博士和蘭州大學汝大福博士為共同通訊作者。

該研究得到宜賓市科技局項目,宜賓學院校級項目基金的支援。(宜賓學院 供稿)